硫自养反硝化技术是以硫化钠(Na2S) 、和硫代硫酸钠(Na2S2O3) 单质硫(S0)等还原态硫源为电子供体， CO32-、HCO3-、CO2作为无机碳源，在缺氧环境下将NO3--N还原为N2的一种新型的自养反硝化技术。

1、硫氮比（S/N）

硫自养反硝化与传统的异养反硝化具有相同的脱氮路径，与C/N比类似，初始的S/N对反应也起着十分重要的作用。S/N过低容易导致反应不完全，S/N过高不仅会导致成本的增加，还有使硝酸盐异化还原成铵的可能。有研究指出硫自养反硝化过程的佳S/N为5:3；佳S/N为5:2。也有其他研究提出S/N为1.3时较好的观点，但这都是以S2-为电子供体得出的结论，对其他种类电子供体的佳S/N研究较少。

2、温度

温度对于硫自养反硝化过程是一个重要的环境因素，对细菌的生长和反硝化的速率有明显的影响。有研究提出脱氮硫杆菌适的生长温度为29.5 ℃，适的反硝化温度为32.8 ℃；试验发现温度在30 ℃~35 ℃条件下有高的硝酸盐去除率；脱氮硫杆菌在28 ℃~32 ℃范围内活性较好；筛选出的菌种在20.0 ℃~35.0 ℃范围内有较好的效果。由此可知，硫自养反硝化的适温度在30 ℃左右。

3、pH

硫自养反硝化反应多为产酸反应，反应过程中pH变化较大，而微生物的适宜pH区间较小，pH的变化会对系统的脱氮效率产生较大的影响。研究发现脱氮硫杆菌生长的适pH为6.8~7.0，S/石灰石滤柱在pH=7.0时系统有大的TN去除率，研究发现在pH小于6.7时，系统的比反硝化速率会快速下降。因此，硫自养反硝化的适pH值约为7.0。